为天麻授粉时，可以同株用同一朵花授粉，也可以采取同株异花或异株异花授粉。还可采用不同类型天麻的花互相授粉。这种授粉所得的种子往往会在生产上表现出意想不到的效果。长期大量的实践证明，异株异花授粉的结实率好于同株同花授粉。

　　杂交授粉是在不同品系之间进行授粉，如红秆天麻 x 乌秆天麻，乌秆天麻 x 绿秆天麻，乌秆天麻 x 红秆天麻，杂交天麻 x 红秆天麻，杂交天麻 x 乌秆天麻，杂交天麻 x 杂交天麻。经过多重杂交以后，可以有效防止麻种的退化，并筛选出优质、高产的天麻新品系。